修行时应当遵守的规则在修行的过程中，可能一不小心，我们的想法和行为，就会跑到不正确的方向上去。如果没有及时察觉，不仅修法没有什么效果，而且还会让我们离目标越来越远。所以，我们得先了解一些修行时，应当遵守的规则，不能任意而为。
修习菩提心的窍诀，
在其中的“修心之学处”中，他讲到了修行人要断除的六种颠倒。
壹｜忍辱的颠倒譬如说：打坐、念经、持咒时间长了，就会感觉疲劳、困乏，就不想继续修了，或者天气很热的时候去放生，因为要走很远的路，放生的鱼又很多，就怕苦怕累，不想去了；但为了做世间法，却再累、再辛苦、再有困难都不怕，都能够承受，这就是忍辱的颠倒。
贰｜意乐的颠倒也即理想的颠倒，作为真正标准的大乘修行人，我们应该树立的理想，是追求众生的幸福而不是个人的幸福，是永久的幸福而不是暂时的幸福，是要让所有众生都获得解脱。 当然，要让所有众生获得解脱，首先我们要自己先成就，那样才有度生的能力。如果我们自己都没有成就，都是烦恼深重的凡夫，又怎么能帮助别人成就呢？ 但一般的世间人却不是以此为目标，而是目光短浅地想尽一切办法，让自己这一生的日子过得好一点儿，这就是理想的颠倒。
叁｜品味的颠倒也即享受的颠倒，如果不愿意通过闻思修持，来享受大乘佛法的智慧和慈悲等精华，反而对吃喝玩乐等等乐此不疲，就是享受的颠倒。
肆｜悲悯的颠倒本来，无论再有钱、有权、有威望，那些根本不修行、不相信因果的世间人都应该是很可怜的。因为在享受金钱、名利、地位等等的过程中，经常会做一些伤害众生的事情，吃活海鲜、穿皮毛等等，从而造作很多恶业，在不久的来世，他们也必将加倍偿还这些血债。但一般人却不会觉得他们可怜，反而对他们锦衣玉食的生活，充满了向往之情。 反之，那些长年居住深山、克服重重困难、不受欲望左右、生活朴素简单的修行人，不少人却认为他们很可怜，没有像样的住处，没有可口的饮食，没有舒适的生活，缺乏基本的物资，这就是颠倒的悲悯。
伍｜营求的颠倒不让依靠自己的人去修行，反而让他们去操持世间法，就是营求的颠倒，也即管理的颠倒或培养的颠倒。 譬如说，世间的国王或官员，不给手下人安排修行的时间，而是让他们去打仗或做一些世间的事务，虽然从世间的角度来说，这是正常的，但也属于营求的颠倒。有些伪装的善知识也是这样，不让自己的弟子去闻思修行，反而让他们去做世俗的事，这就非常不正常了。
陆｜随喜的颠倒在看到或听到别人在世间、出世间方面的善行，修菩提心、出离心、空性，或者做一些世间的善事时，心里产生了喜不自禁的感觉，就是正常的随喜。 但是，如果在其他人修行的时候，心里反而有种不是滋味的感觉，当别人遇到困难、挫折或者生病、死亡的时候却喜出望外、幸灾乐祸，就是颠倒的随喜。
